Matrix Reaktywacja (2003)

Kilka miesięcy po uwolnieniu Neo coraz lepiej rozumie możliwości, jakie daje mu Matrix, lecz przewaga nad agentami nie rozwiązuje najważniejszego problemu. Maszyny rozpoczęły drążenie tunelu prowadzącego w stronę Syjonu, ostatniego miasta wolnych ludzi. Według obliczeń do ataku pozostało niewiele czasu, a mieszkańcy podziemnej enklawy przygotowują się na starcie, którego mogą nie przetrwać. Morfeusz wierzy, że odpowiedź nadal kryje się w przepowiedni dotyczącej Wybrańca. Neo próbuje skontaktować się z Wyrocznią i zrozumieć, jakie zadanie ma wykonać, zanim armia maszyn dotrze do Syjonu. Droga prowadzi przez kolejne warstwy wirtualnego świata oraz ludzi i programy, które mają własne interesy. Jednym z najgroźniejszych problemów staje się agent Smith. Po wydarzeniach pierwszego starcia przestał działać jak zwykły strażnik systemu i zyskał zdolność powielania samego siebie. Neo, Trinity i Morfeusz poszukują sposobu dotarcia do źródła Matrixa. Potrzebują do tego pomocy Klucznika, którego ścigają również inni mieszkańcy programu. Każdy kolejny etap przybliża ich do odpowiedzi, ale odsłania też informacje podważające część przekonań, na których Morfeusz opierał swoją wiarę. W tym samym czasie zegar odliczający do ataku na Syjon nie przestaje działać. Równolegle załogi statków spierają się o to, czy ufać Morfeuszowi, skoro jego plan wymaga podporządkowania wojskowych decyzji przepowiedni, której znaczenia nikt poza nim nie jest pewien.